

代谢物鉴定准确率翻倍提升,高达98% (Level 1)
准确鉴定代谢物数量近10倍提升,高达800+ Level 1代谢物
可靠代谢物总体鉴定数量2000+


- 临床疾病:生物标志物寻找、治疗疗效监控、疾病分型
- 食品:食品营养学、临床营养学
- 畜牧:科学饲养、疾病防治、发育研究
- 药物:药物研发、毒副作用评价
- 中医药:治疗机理、作用靶点分析
- 环境毒理:暴露组学
案例分析
▶ 通过知识驱动的多层代谢网络从已知到未知的代谢注释
Metabolite annotation from knowns to unknowns through knowledge-guided multi-layer metabolic networking
期刊: Nature communication
影响因子: 16.6
时间: 2022年
▶ 研究背景
基于液相色谱-质谱 (LC-MS) 的非靶向代谢组学可以检测样本中已知和未知的代谢物。 然而,未知代谢物的注释是非靶向代谢组学的主要挑战。
▶ 研究结果
在MetDNA2中,作者开发了一种方法,即知识驱动的多层网络技术(Knowledge-guided multi-layer networking, KGMN),以实现代谢组学中从已知到未知的全局代谢物注释。 KGMN方法集成了三层网络,包括基于知识的代谢反应网络、知识引导的MS/MS相似网络和全局代谢峰相关性网络。
▶ 结果展示
利用上述原理,MetDNA 2将已知代谢物的鉴定准确度从70%提升至95%以上,同时还可以注释到约 100-300 个未知代谢物。生物样本中代谢物的鉴定数量可以达到2000-5000.
MetDNA 2可以实现有效的未知注释,并大大推进常见生物样品中经常出现的未知代谢物的发现,从而破译非靶代谢组学中的未知物质。
Fig. 使用化学标准品验证两个未知物:肌苷和肌苷 5'-硫酸盐
